中文名:荧光素 dT 亚磷酰胺
英文名:Fluorescein dT Amidite
Fluorescein dT Amidite(荧光素 dT 亚磷酰胺,6-FAM-dT Phosphoramidite,Fluorescein-dT-CE,FITC-dT Amidite) 是一种专为自动化DNA/RNA合成仪设计的亚磷酰胺单体试剂,由荧光素(Fluorescein)荧光基团、脱氧胸苷(dT)碱基和3'-亚磷酰胺活性基团三部分构成。其分子量约776.62,外观为黄色至橙黄色固体,溶于无水乙腈(ACN),需-20°C惰性气体(氩气或氮气)保护下避光保存。
亚磷酰胺化学是现代寡核苷酸固相合成的核心技术,由Bruce Merrifield于1963年开创并获诺贝尔奖。其基本循环包括四步:去保护(Detritylation)→ 偶联(Coupling)→ 封端(Capping)→ 氧化(Oxidation)。Fluorescein dT Amidite在偶联步骤中,其亚磷酰胺基团在四唑类活化剂(如ETT、DCI)催化下与固载在CPG(可控孔径玻璃珠)上的 growing chain 的5'-羟基反应,形成亚磷酸三酯键,随后被碘溶液氧化为稳定的磷酸三酯键。每个循环的偶联效率需达到99%以上,才能保证20–60 mer长度的寡核苷酸获得可接受的全长产率。
荧光素基团通过其6位氨基上的长链连接臂(通常为6-氨基己酸,即C6 linker)与dT的5位甲基相连。这一连接臂的设计至关重要:它将体积庞大的荧光素与DNA主链隔开,避免空间位阻对杂交效率的影响。同时,C6 linker还能减少荧光素与相邻碱基之间的荧光淬灭效应(即stacking quenching),使标记后的寡核苷酸在游离态和杂交态下均保持高荧光强度。
在实际合成中,Fluorescein dT Amidite通常被安排在寡核苷酸的5'末端或内部特定位置引入。5'端标记最为常用,因为合成仪可在最后一个循环中直接用该单体替代普通dT Amidite。内部标记则需要在合成中途切换试剂瓶,并注意荧光素的二甲基甲酰胺(DMF)溶液在长时间输送管路中可能发生沉淀,因此推荐使用专门的"Fluorescein bottle"和加速脱block方案。
脱保护与切割完成后,粗产物需经反相HPLC纯化。由于荧光素在碱性条件下会开环生成无荧光的醌式结构,所有缓冲液pH须严格控制在7.5以下。纯化后用NanoDrop测定浓度和OD260/OD494比值,理想值应在0.3–0.5之间,表明荧光素与寡核苷酸的标记比例接近1:1。
该试剂是制备荧光定量PCR探针、FISH杂交探针、分子信标(Molecular Beacon)、以及DNA微阵列探针的核心原料,在基因组学和分子诊断基础研究中不可或缺。

产地:西安
供应商:西安球赛在线直播平台 生物科技有限公司
纯度:99%
用途:仅用于科研
温馨提示:仅用于科研,不能用于人体实验!
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