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基于PROTAC的靶向蛋白降解定制服务——西安球赛在线直播平台 生物
发布时间:2026-05-07     作者:kx   分享到:

靶向蛋白降解嵌合体技术是近年来药物研发领域*具突破性的方向之一。与传统的“占位驱动”抑制剂不同,PROTAC分子通过“事件驱动”机制,能够催化降解目标蛋白,有望攻克传统小分子难以靶向的“不可成药”靶点。然而,PROTAC分子的分子量普遍超过“五规则”空间,其设计、合成与成药性评价面临独特挑战。西安球赛在线直播平台 生物提供PROTAC定制服务,涵盖靶点配体筛选、E3泛素连接酶配体匹配、链接子优化、化学合成、体外降解评价及初步药代动力学分析等全流程服务,助力科研人员高效获得功能化降解分子,实现从设计到验证的一体化定制解决方案。

基于PROTAC的靶向蛋白降解定制服务——西安球赛在线直播平台
生物


第一部分:PROTAC定制服务内容

西安球赛在线直播平台 生物在PROTAC领域构建了从分子设计、化学合成到体内外药效评价的全链条技术平台。我们专注于解决PROTAC分子开发中的关键瓶颈,包括:高复杂度双功能分子的合成工艺、连接子构效关系优化、以及药代动力学性质的系统评价。

1.1 PROTAC分子设计与合成

PROTAC分子由三部分构成:靶蛋白配体、E3泛素连接酶配体、以及连接二者的连接子。我们提供这三部分的模块化定制服务:

服务模块

技术内容

关键能力

靶蛋白配体开发

针对POI设计高亲和力小分子配体

覆盖靶点:AR、ER、BRD4、EGFR、KRAS、BTK、CDK9等

E3连接酶配体

VHL、CRBN、IAP、MDM2配体设计合成

CRBN配体:来那度胺、泊马度胺及其衍生物

连接子优化

PEG链、烷基链、刚性/柔性杂化链

长度1-20个原子,支持位点特异性偶联

Linker-free PROTAC

基于单一氨基酸降解信号的无连接子设计

新型设计范式,提升口服生物利用度

1.2 刺激响应型PROTAC前药

传统PROTAC的持续催化活性可能导致脱靶毒性和系统性副作用。刺激响应型PROTAC前药策略通过时空精准控制PROTAC的活化,有效降低毒性。我们提供以下修饰方案:

光响应型:引入光可切除基团,实现特定光照下的精准激活

酶响应型:利用肿瘤特异性酶(如组织蛋白酶、MMP)切断肽链,释放活性PROTAC

ROS响应型:利用肿瘤微环境中高活性氧水平触发药物释放

乏氧响应型:利用实体瘤内部乏氧环境激活降解功能

 

1.3 PROTAC纳米递送系统定制

PROTAC分子的膜穿透性和体内代谢稳定性是限制其临床应用的主要障碍。我们基于临床批准的高分子材料,开发了多种PROTAC纳米组装平台:

PLA-PEG基SM-PROTAC:基于模块化“分合”策略,将靶蛋白配体和E3连接酶配体分别修饰于PLA-PEG纳米胶束表面。该体系在细胞层面可高效降解BRD4、ERα和CDK4,体内给药频率从每天1次延长至每3天1次,显著提升治疗效果

脂质体-PROTAC偶联物:改善PROTAC的药代动力学特性

靶向修饰纳米递送:在纳米载体表面偶联靶向配体(如叶酸、RGD肽),实现主动靶向递送

 

1.4 PROTAC药代动力学评价

PROTAC分子的理化性质超出经典小分子范畴,其DMPK研究面临特殊挑战。我们提供定制化的DMPK评价服务:

评价模块

挑战

解决方案

溶解度评价

不溶或溶解度*低

PBS替代为模拟生理液

通透性/Caco-2

回收率低(非特异性吸附)

添加BSA/血清白蛋白减少吸附

转运体评价

P-gp/BCRP底物判断

hMDR1/hBCRP基因敲入MDCKII模型

代谢稳定性

多种代谢途径并存

综合体系:微粒体+肝细胞+S9+胞浆

血浆蛋白结合

化合物不稳定

添加相应酶抑制剂

代谢产物鉴定

质谱离子源内裂解

优化质谱参数,LC-HRMS鉴定

 

第二部分:定制案例

案例一:基于Abd技术的LMO2 PROTAC

客户需求:针对内在无序蛋白LMO2(T细胞白血病关键致癌转录因子)开发降解剂——该靶点传统小分子难以靶向。

技术方案:基于细胞内*体互补决定区开发的小分子替代物(Abd化合物),偶联VHL或CRBN配体,构建PROTAC分子(Abd-VHL和Abd-CRBN)。

 基于Abd技术的LMO2 PROTAC

案例二:DeepDegradome AI设计的CDK9 PROTAC

客户需求:针对CDK9靶点,开发具有新颖骨架的PROTAC分子。

技术方案:采用DeepDegradome AI生成模型(上海科技大学白芳课题组开发),基于靶标结构感知进行PROTAC的从头设计。模型生成的化合物7/8与CRBN配体泊马度胺通过不同连接子偶联。

 DeepDegradome AI设计的CDK9 PROTAC

 

第三部分:典型高分文献摘抄及翻译

文献一:长效自组装PROTAC体系

标题:Highly efficient and long-acting split-and-mix proteolysis targeting chimera based on self-assembled polylactic acid

期刊:Nature Communications, 2025 (IF > 16.0)

通讯作者:北京大学李子刚教授、深圳湾实验室尹丰研究员

关键原文:*“To circumvent the limitations of traditional PROTACs, we developed a PLA-PEG-based split-and-mix PROTAC (SM-PROTAC) strategy. The self-assembled nanoplatform exhibited efficient degradation of BRD4, ERα, and CDK4 in vitro. Notably, when administered once every three days, the PLA-based SM-PROTAC demonstrated superior tumor growth inhibition compared to daily dosing of the small-molecule degrader ARV-825, indicating significantly extended duration of action.”*

中文翻译:“为规避传统PROTAC的局限性,我们开发了基于PLA-PEG的模块化‘分合’PROTAC策略。该自组装纳米平台在体外可高效降解BRD4、ERα和CDK4。值得注意的是,每3天给药一次的PLA基SM-PROTAC相较于每日给药的小分子降解剂ARV-825显示出更优的肿瘤生长抑制作用,表明其作用持续时间显著延长。”

 

文献二:无连接子PROTAC设计新范式

标题:Linker-free PROTACs efficiently induce the degradation of oncoproteins

期刊:Nature Communications, 2025, 16, 1-15 (IF > 16.0)

关键原文:*“Adopting single amino acid-based degradation signals, we find that the linker is not a required feature of the PROTACs. Notably, the linker-free PROTAC, Pro-BA, exhibits superior efficacy over its linker-bearing counterparts in degrading EML4-ALK and inhibiting lung cancer cell growth. Pro-BA is a water-soluble, orally administered degrader that significantly inhibits the tumor growth in a xenograft mouse model.”*

中文翻译:“采用基于单一氨基酸的降解信号,我们发现连接子并非PROTAC的必要结构特征。值得注意的是,无连接子PROTAC(Pro-BA)在降解EML4-ALK和抑制肺癌细胞生长方面表现出优于含连接子对应物的效果。Pro-BA是一种水溶性、可口服给药的降解剂,在异种移植小鼠模型中能显著抑制肿瘤生长。”

 

第四部分:文献引用链接

综述与进展(机制 + 设计 + 应用)

  • — 深度回顾PROTAC发展历史与现状。

  • — 总结TPD与E3泛素连接酶相关设计元素。

  • — 最新视角从机制到临床转化。

化学设计与优化

  • — 详细介绍双功能PROTAC设计化学与优化策略。

  • — 阐述基于PROTAC机制的降解技术进展。

疾病应用案例

  • — PROTAC在癌症靶向治疗中的实际应用与挑战。

 

第五部分:PROTAC相关产品列表

产品名称

靶点

E3配体

关键特性

ARV-110类似物

AR

CRBN

雄激素受体降解剂

ARV-471类似物

ERα

CRBN

雌激素受体降解剂

BRD4 PROTAC

BRD4

CRBN/VHL

BRD4蛋白高效降解

CDK9 PROTAC

CDK9

CRBN

DC50=9.6 nM

BTK PROTAC

BTK

CRBN

布鲁顿酪氨酸激酶降解

EGFR PROTAC

EGFR

CRBN/VHL

克服奥希替尼耐药

PLA-PEG-SM-PROTAC

BRD4/ERα/CDK4

CRBN

长效缓释纳米制剂

Abd-VHL

LMO2

VHL

*LMO2特异性降解

光响应型PROTAC

定制靶点

CRBN

紫外光可控激活

 


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